Przy projektowaniu ogrzewania podłogowego należy uwzględnić odpowiednią ilość miejsca na warstwę docieplenia. Poprawna grubość powłoki izolacyjnej zabezpieczy dom przed utratą ciepła do ziemi i podbudowy. Im grubsza warstwa tym lepiej, aczkolwiek zazwyczaj przyjmuje się wartość przynajmniej 100mm dla posadzki na gruncie, natomiast dla stropu akceptuje się wartość około 25 mm. Przez umieszczenie odpowiedniej warstwy ochronnej szacuje się, że 85% ciepła wraca z powrotem do budynku. Do docieplenia podłogi stosuje się płyty styropianowe typu EPS lub XPS. Pierwszy typ styropianu formują spienione granulki ściśnięte w blok, który następnie cięty jest na mniejsze tafle. Jego powierzchnia zawiera pory, co powiększa jego właściwości do nasiąkania. Bardziej praktycznym rozwiązaniem są płyty XPS, które wytwarzane są o docelowych rozmiarach. Tafle te posiadają jednolitą strukturę o płaskiej powierzchni. Ważną kwestią jest klasa płyt styropianowych, czyli ilość surowca wykorzystana na wyprodukowanie określonej paczki styropianu. Im wyższa waga tym właściwości izolacyjne są lepsze. Do zaizolowania ogrzewania podłogowego nie stosuje się folii metalizowanej gdyż nie posiada ona cieplnych cech ochronnych. Wykorzystuje się ją w celu zabezpieczenia paneli ze styropianu przed wodą z wylewki betonowej oraz do wytyczania miejsc na rury wodnej podłogówki.
